成书背景
马印麟认为，自古以来张仲景、刘河间、李东垣、朱丹溪可谓岐黄之四大明师，但“惟有瘟疫一门而未尝发明受病之由”。导致“凡遇瘟疫之症，流行颠倒差乱，误人多多。”后来，马氏在青州医药世家张宗玉处得其所藏张景岳《类经》，对其中的五运六气之说十分赏识，认为如果能明五运六气之至要，则可知为瘟疫时症之根源，故书名为《瘟疫发源》。此书成书之后，存放了三十余年，在此期间马氏注意观察运气与瘟疫发生的关系，认为是“屡验屡效”，所以才将此书刊刻出版，并将观察结果附在书前。
马印麟，字长公，号好生主人，古青（今山东益都）人。据其《瘟疫发源》雍正三年（1725年）自序署名“三世医八十老人马印麟”，其生年当为1645年。而其90岁时（1735年）还出版了最后一部著作《救急良方》，其逝年当不早于此年。马氏三世业医，自幼随祖父学医。父辈去世后，又“各处访求明师贤友”。对瘟疫的诊治颇有体会，遂成《瘟疫发源》一书。
内容简介
《瘟疫发源》选取张景岳《类经》中关于五运六气的内容，预测每年的主气与客气“和”或“不和”。马印麟指出“凡主气者，年年不移。客气者，每岁而迭迁”，所以他以干支年为序，逐年分析此年的主客之气、岁运特点，以及气候、物产与疾病。通过这种推算，预测某年可能有瘟疫流行而早做准备。他认为“若主客之气正化，则天时风雨调和而五谷丰收，则民亦舒而无病。然一岁之中，全在客气之流行变化。若主客之气不和，阴阳不得升降，则五行相制，天时寒热温凉，不应主气，则天有不测之气象，风云雷雨，旱涝不均。五谷亦不能丰收，而民多患灾难疫疠之热症。”并对气运不同的不同年份提出了相应的不同治法，最后提出7个药方，用于不同气运年的瘟疫防治。
流传版本
书评序言
《瘟疫发源辨论》序
医之为道，盖自上古神圣，参天地阴阳之秘，以跻一世于和平，其功最大。自后世侪于方技之列，痛夫俗子咸托业于其间，以为衣食计，品益杂，技日疏，几以人为费而医之道隐矣。古人有言“不为良相则为良医”，医岂易言哉?北海马君长公，当代良医也。尝往来历下，与余交甚久。每见其治疗奇验，真所谓“饮上池之水而洞见垣一方”者。其品高行粹，淹博儒雅，盖隐君子者流姑托迹于是，岂与世之碌碌者同乎一日?出其所著《瘟疫发源辨论》二册示余，约而该，微而显，辨析毫芒，治法毕具，至哉!书乎。余尝历览古今来所刻方书，于疫疠一途详者或鲜。盖诸症或出于人事，而此症则本乎天行，使非通于阴阳五行之理，而究极其微，或爽毫厘，误人非细。今观是书，五运六气，洞彻条贯，造化根心调燮在手，能使垂沴之气变为甘雨和风，厥功伟矣。是书之行，诚足以上继古来神圣济世之心，宁仅曰方伎家言而已哉?因乐弁数语于首，以告夫世之读是书者。
时雍正二年岁次甲辰长至日平陵杨瑄序于倩月山房
自序
予年八十岁，细自数十岁时受祖父之岐黄医业，从师训读数载。父亡之后，各处访求明师贤友，讲究议论。至于前辈如东垣、丹溪、河间、仲景四大明师岐黄，将诸病、脉理、经络脏腑、本草无不注释，详悉明白，惟有瘟疫一门而未尝发明受病之由。诸家虽有数句，至简至约，不甚详细，闷怀心腹二十余年。凡遇瘟疫之症，流行颠倒差乱，误人多多。忽而青州，宗玉张公，亦是世家岐黄，所积之书，赐《类经》一部，四十余册。朝夕昼夜苦读穷究，黄帝与岐伯注天文地理，人事三才，其书理义深远，繁多难读，盖学浅不能便览。吾将瘟疫一门，由博返约，采集一册，名曰《瘟疫发源》，使后人便易入门。至今三十余年，屡验屡效。方敢刊刻济人。所验之年岁，略表一二，开例于下，以使后学诚信。再求高明指示。
雍正三年岁次乙已古青三世医八十老人马印麟甫纂
《瘟疫发源》小引
夫医学源自伏羲，传之神农，注于皇帝。故轩辕与岐伯参酌天地阴阳，化生六气，运行一岁十二月之间。分布在人，为手足三阴三阳十二经，左右要会，作八十一篇，垂为世范，至今用之而为医家绳墨规模者也。粤自黄帝之后，二千五百余年。汉长沙张仲景先生恤于民命多被伤寒瘟疫损害横夭，因而详考古经函微之玄机，气运主客之迁变，以著《伤寒卒病方论》一十六卷，使后之学者有可依据。仲景迄今又千余载，凡著作医书遏往古者八九倍矣。然皆究其末而不求其本。青齐长翁马先生尧善岐黄，洞彻奥秘，千经百论，无不探本穷源。其手著《瘟疫发源辨论》上下卷，发明五运六气之至要，为瘟疫时症之根源。其言简，其理明，易于习诵，使人知所由来，其用心可谓深且大矣。诚灵书之纂要，后学之指迷，瘟疫之秘诀，生人之厚幸耶。桓毫末无知，不自揣其鄙陋，妄笔而志之，幸勿哂其俚劣云。
时雍正三年岁次乙已蒲月上浣之吉
古燕同学弟余东桓敬远氏识于泺滨倩月斋之西堂
影响评价
章节目录
瘟疫则验
瘟疫治法表其大略
瘟疫病按
五运六气瘟疫发源
五运详注
六气详注
六气分主客
司天在泉左右间气
司天在泉解
五运详注原病
六气天时民病
五运五郁天时民病详解
禹贡九州分野八卦定位
十二地支方位
五运六气药方
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